Sáng ngày 9/6/2009, tại TP Nha Trang, UBND tỉnh Khánh Hoà tổ chức Hội thảo Bảo tồn đa dạng sinh học vịnh Nha Trang. Đông đảo các nhà khoa học, đại diện tổ chức phi Chính phủ, các bộ, ngành Trung ương tham gia, thảo luận nhằm tìm biện pháp phát triển du lịch gắn với bảo vệ môi trường biển.
Theo kết quả nghiên cứu, vịnh Nha Trang là nơi có hệ sinh thái đa dạng sinh học bậc nhất Việt Nam, với hơn 440 loài động vật không xương sống, trong đó có nhiều loài mới được phát hiện ở Việt Nam, 350 loài san hô, 300 loài cá. Trước tốc độ phát triển kinh tế xã hội, du lịch và việc khai thác quá mức, vịnh Nha Trang đang bị ô nhiễm nghiêm trọng, nhiều diện tích san hô bị phủ lấp, ngày càng suy giảm.
Tại hội thảo, Viện Nghiên cứu Nuôi trồng thuỷ sản, Viện Hải dương học Nha Trang, Trung tâm Nhiệt đới Việt Nga đề xuất các giải pháp bảo tồn đa dạng sinh học, đề nghị chính quyền cần quy hoạch sử dụng hợp lý theo quan điểm quản lý tổng hợp vùng bờ; doanh nghiệp du lịch phải bắt buộc đầu tư vào bảo tồn và sử dụng hợp lý vịnh; đẩy mạnh truyền thông nâng cao nhận thức của cư dân và du khách đối với môi trường biển...cũng như tiến hành nuôi trồng các loại thuỷ sản có lợi, trồng cỏ biển, rừng ngập mặn...
Ông Nguyễn Thiết Hùng, Chủ tịch Hội Khoa học Kỹ thuật biển Khánh Hoà nêu ý kiến: Qua báo cáo của các nhà khoa học các chuyên gia, tôi thấy có nhiều điểm mới. Tuy nhiên vấn đề không phải chỗ đó mà là chính quyền tỉnh Khánh Hoà phải đưa những điểm mới đó áp dụng vào thực tiễn trong thời gian sắp tới. Những doanh nghiệp du lịch hưởng lợi từ sự sạch đẹp của vịnh Nha Trang phải đóng góp vào ngân sách chứ không thể ngân sách lo mãi được.